高院的裁決引起爭議，基本法委員會副主任譚惠珠說，法庭忽略人大常委會於香港回歸前已將《緊急法》採用為特區法律的事實，認為政府應上訴至終審法院；至於人大常委會是否要釋法，她指要視乎案件如何繼續處理，若案件到終院，人大常委會才會考慮釋法。人大常委譚耀宗亦指政府應考慮向終院上訴釐清問題，並指人大常委會有權釋法，但應小心謹慎運用，最好由終院矯正。
(林俊源攝)
大律師公會發表聲明，指法工委說法在法律上錯誤，香港法院以往曾宣告某些違憲法律條文無效，法院運用這權力未曾受質疑；另《基本法》列明香港享有獨立司法權和終審權，任何言論主張香港法院不能裁定法律條文是否違反《基本法》，是限制香港法院一向享有的獨立司法權，亦違反《基本法》，破壞香港高度自治。
前基本法起草委員李柱銘(圖)認為，高院的判決完全正確。他指終院在99年吳嘉玲案的判辭，清楚講明香港所有法庭都享有有關的研究權，即特區法庭有權研究人大常委會所作的決定是否符合《基本法》，人大常委會當年就《基本法》第158條釋法時，亦無反駁有關講法。他又說，法工委有權就判決表達意見，但無法干預裁決。
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