治療膀胱石的原則，是把結石取出，並同時處理形成結石的原因。多數個案都可以同時處理兩種情況。
治療方法：
1. 體外震波碎石
把碎石機放在肚皮上，一下一下的震碎膀胱石。
2. 經尿道碎石術
從尿道放入一支鏡上膀胱，看到結石後，就用以下其中一種方法來弄碎膀胱石。
(i) 器械鉗：可以把膀胱石鉗碎。
(ii) 激光：把激光纖維放進膀胱，利用激光把結石打碎。
(iii) 氣壓彈道：把一根很幼的鐵管放進膀胱，用氣壓震碎結石。
(iv) 超聲波：利用超聲波來碎石。
(v) 液電：放一條電線到膀胱裏，像光管跳線一般，「啪、啪」地碎石。
與腎石不同的是，放進腎臟的管道較粗，因此多種碎石方法都能用得上；但尿道很幼，只能放進幼細的儀器，所以碎石方法有限制。
3. 恥骨上膀胱切開取石術
在腹部開刀，剖開膀胱，取出結石。這手術通常只於用較大的結石。直徑5厘米以上的結石，通常都要開刀。
上述兩種碎石方法，都只適用於小過5厘米的結石。若要震碎大於5厘米的結石，可能五、六小時都未能完成。碎石後，碎片多數可以自行排出，但患者應定期覆診，以確定碎石片已全部清除。惟病人若受感染，則在感染期間不能進行碎石的治療，以免令細菌擴散。