腎臟癌的治療，以外科切除手術最為理想，也是唯一能治癒的方法，但這只限於早期的腎臟癌。手術可以用傳統開刀方式，也可以採用微創的腹腔鏡方式進行。
通常醫生會把患癌的整個腎臟摘去，連同包覆其外的筋膜，以及鄰近的輸尿管上段、腎上腺、淋巴腺等，作大範圍切除，期望把癌細胞清得乾乾淨淨，一個不留。手術後五年的存活率約80%。
可是，即使早期切除腎癌有高達八成的存活率，但術後仍有三成風險會復發或轉移，換言之，這些病人在切除早期腎癌時，其實癌細胞已在暗中走開了，只是當時沒辦法驗到而已。
小於7公分的腎腫瘤多屬第一期，其實7公分是相當大的。若果找到一個3公分大的腫瘤，應該怎麼辦？「醫生，把整個腎切去，很浪費吧！」也是的，所以有腎臟保留治療法的出現，就是當腫瘤較為細小，仍未擴散時，把腫瘤連同部分腎臟切除。
這種手術可以微創進行，利用腹腔鏡或機械手臂來做，已經越來越普遍；而且在控制癌症方面的療效相當好。
約有一成的腎臟小腫瘤，在切除後化驗證實為良性，即是腎嗜酸細胞瘤，而非癌細胞。
即使腎臟癌已經擴散，病人仍有可能進行切除手術，但目的並非為了治療癌症，而是為了去除病徵，例如當病人血尿不斷，又或腫瘤引致腰痛，便會進行腎臟切除手術，術後病人的癌病情況沒有明顯改進，但卻可改善病人的生活質素。
腎癌患者中，晚期才發現的比率仍偏高，因此雖不入十大癌症，但因一般較遲發現，加上癌細胞的極度惡性，患者存活率在癌症中仍是較低的。